Unterscheidung von Relapse und Re-Infektion bei Hepatitis-C-Therapie
Wenn nach einer erfolgreichen Hepatitis-C-Therapie das Virus erneut im Blut nachweisbar ist, stellt sich die wichtige Frage: Handelt es sich um einen Relapse (ein Rückfall, also ein Therapieversagen) oder um eine Re-Infektion (eine neue Ansteckung)? Die Unterscheidung ist entscheidend für die weitere Behandlung. Während bei einem Relapse in der Regel eine gezielte Zweitlinientherapie erforderlich ist, wird eine Re-Infektion wie eine neu diagnostizierte Infektion behandelt.
Um diese Unterscheidung schnell und zuverlässig zu ermöglichen, arbeitet das NRZ-HCV an der der Entwicklung eines Algorithmus. Dieses Tool nutzt genetische Daten des Hepatitis-C-Virus (HCV), um auf Basis von Sequenzvergleichen zwischen einem Relapse und einer Re-Infektion zu unterscheiden.
Wie funktioniert das Tool?
Das Tool basiert auf umfangreichen wissenschaftlichen Daten und modernsten bioinformatischen Verfahren. Ein speziell entwickelter Algorithmus nutzt Sequenzdaten aus mehreren Quellen, darunter bekannten Re-Infektions- und Ausbruchsszenarien. Diese Daten wurden zu einem robusten Lerndatensatz zusammengeführt. Nach anfänglichen Schwierigkeiten mit kleineren Datensätzen konnte die Genauigkeit und Stabilität der Vorhersagen durch eine Erweiterung des Datensatzes erheblich verbessert werden.
Das Tool nutzt modernste Technologien, um genetische Sequenzen zu analysieren und phylogenetischen Beziehungen zwischen den Sequenzen (also die “Verwandschaftsverhältnisse” der Viren) darzustellen. Dadurch können Faktoren abgeleitet werden, die die Unterscheidung von Relapse und Re-Infektion ermöglichen.
Fortschritte und zukünftige Entwicklung
Mittlerweile umfasst die zugrunde liegende Datenbank über 43.000 Vergleichssequenzen, ergänzt rund 200 Vollgenom-Referenzsequenzen. Diese umfangreiche Datengrundlage ermöglicht eine präzise Analyse und verbessert kontinuierlich die Qualität der Vorhersagen. Die Entwicklung des Tools wird kontinuierlich vorangetrieben, um sowohl die Benutzerfreundlichkeit als auch die Datenqualität zu optimieren. Das Tool wird in Kürze als Demoversion veröffentlicht.
Mit diesem Fortschritt leistet das NRZ-HCV einen wichtigen Beitrag zur Optimierung der HCV-Therapie und zur Verbesserung der Versorgung von Patientinnen und Patienten weltweit.