Analyse der kodierenden Exons
Analyse der kodierenden Sequenz sowie der angrenzenden Exon-Intron Bereiche der Gene:
- ATP8B1 (FIC1)
- ABCB11 (BSEP)
- ABCB4 (MDR3)
- ABCC2 (MRP2)
- TJP2
- NR1H4 (FXR)
Diese Gene kodieren für Proteine, die in den Leberzellen für die Bildung der Galle und deren Ausscheidung in die Gallenkanälchen von Bedeutung sind (siehe Abb.).
Mutationen in diesen Genen könnten zur Entwicklung cholestatischer Lebererkrankungen wie den sogenannten benignen rekurrenten intrahepatischen Cholestasen (BRIC Typ 1 und 2, betroffene Gene ATP8B1 und ABCB11), den verschiedenen Formen der progressiven familiären intrahepatischen Cholestase (PFIC Typ 1-3, betroffene Gene ATP8B1, ABCB11 und ABCB4), dem kürzlich beschriebenen PFIC-ähnlichen Krankheitsbild (PFIC Typ 4, betroffenes Gen TJP2), der intrahepatischen Schwangerschaftscholestase (ICP, betroffene Gene ATP8B1, ABCB11 und ABCB4, NR1H4), dem Low Phospholipid-Associated Cholelithiasis-Syndrom (LPAC, betroffenes Gen ABCB4) oder dem Dubin-Johnson-Syndrom (DJS, betroffenes Gen ABCC2) führen. Bestimmte, zumeist häufige Varianten dieser Gene haben außerdem eine Bedeutung für die Entstehung medikamentös-toxischer Leberschäden (DILI) und können mit einer Erhöhung verschiedener Leberwerte assoziiert sein.
Es wurden für alle oben erwähnten Gene bereits zahlreiche neue Mutationen im hiesigen Cholestaselabor identifiziert.
Methoden: Sequenzierung der kodierenden Exons und benachbarten Exon-Intron Grenzen oder Cholestase Chip (NGS) (ATP8B1, ABCB11, ABCB4, NR1H4). Es erfolgt bei beiden Methoden keine Abdeckung der regulatorischen Bereiche und der kompletten Intronsequenzen. NGS-Methoden werden durch das Genomics & Transcriptomics Labor (Leiter: Prof. Dr. K. Köhrer) des Biologisch-Medizinischen Forschungszentrums (www.bmfz.de) durchgeführt.
Literatur (Auswahl):
Düsseldorfer Kompendium: Gastroenterologie, Hepatologie und Infektiologie. Häussinger, D., ed., (2009) University Press Düsseldorf, Düsseldorf
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Hepatobiliary Transport in Health and Disease. Häussinger, D., Keitel, V., Kubitz, R. eds., (2012) de Gruyter Verlag, Berlin
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